仓鼠细胞STR鉴定怎么做?

仓鼠细胞的STR（短串联重复序列）鉴定主要用于确认细胞系的身份和检测是否存在交叉污染。以下是仓鼠细胞STR鉴定的关键步骤和方法：

1. STR鉴定的适用性

目前，STR鉴定主要适用于人源和小鼠细胞系，技术相对成熟，并有完善的数据库支持。

仓鼠细胞，仓鼠11个STR基因座位点，可区分CHO,CHO-K1,CHL,CHK,V79等不同中国仓鼠细胞的STR鉴定（自研数据库）。

2. 种属鉴定替代方案

由于仓鼠细胞STR数据库不完善，可采用线粒体COI基因种属鉴定来确认细胞来源及检测种间交叉污染：

方法：提取细胞DNA，使用种属特异性引物扩增线粒体COI基因，通过电泳分析片段大小：

中国仓鼠：315 bp

人类：391 bp

小鼠：150 bp

大鼠：196 bp

猴类：222-287 bp9。

3. STR鉴定的尝试（如适用）

如果实验室或供应商提供仓鼠STR检测服务，可参考以下流程：

样本准备：收集细胞（T25培养瓶足够）或提取DNA。

检测机构：选择专业机构进行STR分型。

数据分析：若数据库中有参考STR数据（如某些CHO细胞系），可进行匹配度分析（≥80%视为同源）。

4. 质量控制建议

交叉污染检测：即使无法STR比对，仍需排查人源或其他物种污染（如人源STR位点检测）。

细胞来源验证：从ATCC、ECACC等权威库引种，并要求提供COA（分析证书）和STR报告（如适用）。

5. 替代鉴定方法

染色体核型分析：确认仓鼠细胞的特异性染色体模式。

同工酶电泳：如LDH（乳酸脱氢酶）同工酶谱分析。

基因测序：关键基因（如β-actin、GAPDH）测序比对。

总结。

尽管目前仓鼠细胞STR鉴定仍面临技术限制，一些公司采用COI基因种属鉴定结合其他方法（如核型分析）进行身份验证。但是，美德华生借对细胞STR鉴定的多年积累，结合对中国仓鼠细胞的生信和验证分析，历经多年筛选出可以区分CHO,CHO-K1,CHL,CHK,V79等不同中国仓鼠细胞的STR鉴定体系，已经可以提供仓鼠STR鉴定服务。